Dit koororgel bevindt zich op de muurkolom tussen de Sint-Joriskapel en de Weitkoperskapel. Het wordt ook wel het transeptorgel of het kleine orgel genoemd. Het huidige orgel, dat in de periode 1658-1559 gebouwd is, is het vierde orgel op die plek. Tot 1544 zat het ‘Edammer werck’ orgel hier, vanaf 1544 het tweede orgel (gemaakt door Hendrick Niehoff) en vanaf 1567 het derde orgel door Pieter Jansz de Swart. De oorspronkelijk functie van het koororgel was om het koorgezang te begeleiden.
